More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3178 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  100 
 
 		 91 aa  180  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  79.07 
 
 		 89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  73.03 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  75.82 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  79.07 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  76.47 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  73.26 
 
 		 89 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  74.42 
 
 		 90 aa  132  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  74.42 
 
 		 89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  71.76 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  67.42 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  65.88 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  68.24 
 
 		 88 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  69.41 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  64.71 
 
 		 88 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  67.44 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  67.44 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  62.64 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  65.88 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  65.06 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  61.9 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  59.34 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  70.59 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  61.18 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  61.63 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  62.64 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  61.18 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  61.18 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  62.64 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  61.18 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  62.5 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  59.34 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  60 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  60.44 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  60 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  60.44 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  58.82 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  58.82 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 89 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  59.52 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 89 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  58.82 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01764  30S ribosomal protein S15  62.64 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00913478  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  61.9 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  60 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3955  ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  56.63 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  60.44 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  60.44 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0993  30S ribosomal protein S15  56.47 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.163035  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1099  30S ribosomal protein S15  57.78 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>