276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2388 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  43.53 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  34.69 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  40.23 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  37.84 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  41.46 
 
 		 117 aa  67  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  36.46 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  36.14 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  40.24 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  30.12 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  36.96 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  34.83 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  42.17 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  34.83 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  34.83 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  34.83 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  34.83 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  34.83 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  34.83 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  40.24 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  38.71 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  31.46 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  31.46 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  38.96 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  32.95 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  37.18 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  36.14 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  37.35 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  32.35 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  33.71 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  45.31 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  33.7 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  32.53 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  39.24 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  35.23 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  35.23 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  33.71 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  35 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  34.88 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  32.58 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  32.95 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  32.58 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  32.14 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  34.94 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  32.58 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  27.71 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  34.62 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  34.62 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  34.62 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  34.62 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  32.05 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  34.25 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  34.15 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  34.85 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  29.21 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  29.21 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>