More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1913 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  100 
 
 		 149 aa  299  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  66 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  63.95 
 
 		 155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  63.16 
 
 		 156 aa  189  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  63.82 
 
 		 164 aa  188  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  61.04 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  62 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  58.11 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  56.77 
 
 		 159 aa  174  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  58.78 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  58.28 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  57.69 
 
 		 157 aa  167  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  54.25 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  56.08 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  55.03 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  56.08 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  55.77 
 
 		 170 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  53.64 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  60.14 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  53.02 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  54 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  54.36 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  53.33 
 
 		 184 aa  157  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  55.63 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  54.36 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  52.7 
 
 		 186 aa  153  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  54.67 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  53.64 
 
 		 187 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  52.98 
 
 		 201 aa  150  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  53.33 
 
 		 182 aa  148  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 		 188 aa  147  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  57.24 
 
 		 179 aa  145  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  52.7 
 
 		 182 aa  143  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  51.35 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  52.08 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  38.17 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  35.95 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  35.95 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  45.61 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  43.48 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  39.74 
 
 		 301 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  44.21 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  41.96 
 
 		 446 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  40.17 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.16 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  31.54 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  35.82 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  37.82 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  37.39 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  33.55 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  38.1 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  38.1 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  32.48 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  41.38 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.67 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  41.38 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.67 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.67 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.67 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.67 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.67 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.67 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  37.39 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  41.96 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  32.32 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  40.52 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  35.9 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  39.45 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  41.59 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  33.54 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  39.66 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  39.64 
 
 		 180 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  34.65 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1642  protein of unknown function UPF0054  44.12 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208313  hitchhiker  0.00194767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  40.17 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  36.36 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  40.54 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  34.97 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  43.64 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  35.34 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  38.46 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  37.7 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  42.11 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  29.14 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  36.49 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  36.49 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  40.91 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  34.23 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  39.82 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  39.09 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  41.35 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  38.53 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  39.45 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  40.52 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.98 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  35.83 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>