More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0077 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  100 
 
 
331 aa  630  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  59.63 
 
 
327 aa  342  3e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
328 aa  223  5e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  43.03 
 
 
327 aa  222  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  40.95 
 
 
324 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  39.56 
 
 
314 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  38.61 
 
 
340 aa  179  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2090  inner-membrane translocator  43.93 
 
 
335 aa  174  2e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
311 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 
311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 
311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 
311 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35.28 
 
 
311 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  39.67 
 
 
311 aa  166  7e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 
311 aa  166  7e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.34 
 
 
311 aa  165  1e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.34 
 
 
311 aa  165  1e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  39.67 
 
 
311 aa  165  1e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.76 
 
 
312 aa  164  1e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  39.54 
 
 
311 aa  164  2e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.30424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  36.11 
 
 
359 aa  162  8e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.91616e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.22 
 
 
311 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.52632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 
306 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  41.96 
 
 
314 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 
332 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.04 
 
 
323 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 
334 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 
348 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.28 
 
 
330 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 
330 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.28 
 
 
330 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  6.2023e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.42 
 
 
324 aa  153  3e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
309 aa  154  3e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.92 
 
 
322 aa  154  3e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 
334 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 
334 aa  153  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  39.45 
 
 
322 aa  152  6e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
323 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  38.94 
 
 
333 aa  150  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  34.34 
 
 
335 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 
335 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  36.21 
 
 
316 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 
322 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  37.78 
 
 
322 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.06 
 
 
336 aa  148  1e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  35.96 
 
 
348 aa  148  1e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.69 
 
 
327 aa  148  1e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
321 aa  148  1e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  36.42 
 
 
334 aa  147  2e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  34.27 
 
 
335 aa  147  2e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  38.01 
 
 
336 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  34.56 
 
 
335 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.6 
 
 
331 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 
345 aa  146  4e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
345 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  35.49 
 
 
320 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
345 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4552  D-allose transporter subunit  36.45 
 
 
326 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03958  D-allose transporter subunit  36.45 
 
 
326 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3905  Monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 
326 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 
335 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  36 
 
 
322 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03918  hypothetical protein  36.45 
 
 
326 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.33 
 
 
345 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3940  D-allose transporter subunit  36.45 
 
 
326 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.03 
 
 
350 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  34.24 
 
 
327 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.89 
 
 
322 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
315 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  38.08 
 
 
321 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  38.08 
 
 
321 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  38.08 
 
 
321 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  38.08 
 
 
321 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  38.08 
 
 
321 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 
331 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  39.14 
 
 
315 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
342 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 
342 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.62 
 
 
310 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 
337 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  39.41 
 
 
333 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.33 
 
 
334 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  37.71 
 
 
321 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.1 
 
 
310 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  34.41 
 
 
328 aa  141  2e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  40.56 
 
 
327 aa  141  2e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 
835 aa  140  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  37 
 
 
336 aa  141  2e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  34.14 
 
 
329 aa  141  2e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
325 aa  141  2e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  34.62 
 
 
338 aa  141  2e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  36.53 
 
 
321 aa  141  2e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  7.74907e-07 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
325 aa  141  2e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  30.67 
 
 
338 aa  140  2e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  40.91 
 
 
337 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.95 
 
 
322 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  32.15 
 
 
341 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 
324 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
337 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  34.64 
 
 
345 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>