More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2758 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  78.63 
 
 
468 aa  725    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  76.34 
 
 
503 aa  731    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  100 
 
 
468 aa  939    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  77.2 
 
 
467 aa  743    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  68.47 
 
 
547 aa  621  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  68.25 
 
 
547 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  67.67 
 
 
561 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  67.67 
 
 
561 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  68.32 
 
 
561 aa  608  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  67.67 
 
 
561 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  68.45 
 
 
562 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  67.67 
 
 
561 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  67.45 
 
 
561 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  68.31 
 
 
564 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  67.88 
 
 
561 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  66.6 
 
 
561 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  67.45 
 
 
561 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  68.31 
 
 
564 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  67.17 
 
 
561 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  67.38 
 
 
565 aa  601  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  68.03 
 
 
562 aa  599  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  68.68 
 
 
561 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  66.67 
 
 
560 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  66.52 
 
 
562 aa  578  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  59.05 
 
 
479 aa  552  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  57.02 
 
 
551 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  54.86 
 
 
550 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  57.14 
 
 
552 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  58.92 
 
 
541 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  53.94 
 
 
479 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  46.22 
 
 
546 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  44.19 
 
 
546 aa  386  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  44.19 
 
 
546 aa  385  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.22 
 
 
473 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  47.46 
 
 
546 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  48.2 
 
 
548 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  44.7 
 
 
767 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  45.97 
 
 
767 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  45.22 
 
 
475 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  47.26 
 
 
550 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  47.02 
 
 
476 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  44.49 
 
 
745 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  44.12 
 
 
479 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  46 
 
 
476 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  46 
 
 
476 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  46 
 
 
476 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  46.91 
 
 
481 aa  353  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  44.42 
 
 
480 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  46.12 
 
 
482 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  46.33 
 
 
474 aa  342  7e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  46.04 
 
 
467 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  45.91 
 
 
474 aa  340  5e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  43.78 
 
 
476 aa  329  7e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  43.44 
 
 
457 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  44.04 
 
 
478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  40.04 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  44.35 
 
 
477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  38.74 
 
 
469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  40.85 
 
 
468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  45.43 
 
 
557 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  40.51 
 
 
468 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  42.49 
 
 
458 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  39.25 
 
 
469 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  35.87 
 
 
464 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.83 
 
 
471 aa  266  8e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  37.74 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  33.77 
 
 
484 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  34.6 
 
 
460 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  34.42 
 
 
453 aa  251  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  34.2 
 
 
485 aa  250  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.79 
 
 
462 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.72 
 
 
456 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  36.44 
 
 
448 aa  246  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  40.24 
 
 
459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  35.62 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1392  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.15 
 
 
417 aa  239  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.88 
 
 
492 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.13 
 
 
473 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  32.96 
 
 
464 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  35.11 
 
 
515 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.19 
 
 
471 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.31 
 
 
482 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.26 
 
 
717 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  32.51 
 
 
464 aa  236  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.91 
 
 
722 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.24 
 
 
484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.27 
 
 
722 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  36.38 
 
 
507 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  31.52 
 
 
449 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.03 
 
 
470 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.37 
 
 
482 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.41 
 
 
713 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  33.96 
 
 
516 aa  233  7.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  33.03 
 
 
460 aa  232  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.37 
 
 
475 aa  232  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.1 
 
 
470 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.48 
 
 
475 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.56 
 
 
470 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.48 
 
 
475 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  35.28 
 
 
510 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>