More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2705 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  100 
 
 		 259 aa  526  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  69.8 
 
 		 188 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  66 
 
 		 178 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0850  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.48 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.223684  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0994  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.48 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0262542  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  66.44 
 
 		 183 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  72.31 
 
 		 192 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  46.58 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  68.22 
 
 		 193 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  62.31 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  62.31 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  62.31 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  62.31 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  62.31 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  62.31 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1006  ferredoxin  44.92 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.110987 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  62.31 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  46.8 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2349  ferredoxin  50.56 
 
 		 306 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0951  ferredoxin  61.54 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0971  ferredoxin  62.31 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1714  ferredoxin  60.77 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2326  ferredoxin  60.77 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  67.44 
 
 		 192 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  61.24 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  44.58 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0872  ferredoxin  40.46 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  50.56 
 
 		 334 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0937  ferredoxin  43.75 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  60.77 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  60.77 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  61.24 
 
 		 279 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  65.89 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  62.5 
 
 		 188 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  66.67 
 
 		 198 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  58.46 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  67.69 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  64.84 
 
 		 180 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.1 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.06 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  64.34 
 
 		 194 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  67.44 
 
 		 191 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2064  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.06 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.295108 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0464  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.85 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0463817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.83 
 
 		 335 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.59 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  61.24 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  60.47 
 
 		 193 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  60.47 
 
 		 204 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  60.47 
 
 		 204 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  60.47 
 
 		 204 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  63.85 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  60.47 
 
 		 193 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  59.69 
 
 		 199 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  60.47 
 
 		 199 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  60.47 
 
 		 199 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  60.47 
 
 		 193 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  65.62 
 
 		 188 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  60 
 
 		 205 aa  164  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  60 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.16 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  65.62 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  60.94 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  54.67 
 
 		 207 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  54.67 
 
 		 207 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  62.79 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  54.67 
 
 		 188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  59.85 
 
 		 195 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  61.24 
 
 		 189 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  58.14 
 
 		 137 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  60.77 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2341  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.55 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0747882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  60.77 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  58.21 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.21 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  56.39 
 
 		 189 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  58.21 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  58.21 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  58.21 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  58.21 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2376  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.29 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.532877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.2 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  58.21 
 
 		 192 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  58.21 
 
 		 192 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  58.21 
 
 		 192 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  58.52 
 
 		 189 aa  158  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  58.91 
 
 		 189 aa  158  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  58.59 
 
 		 142 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  56.92 
 
 		 139 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  56.92 
 
 		 139 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.25 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  56.93 
 
 		 194 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  55.47 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  55.47 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1556  electron transport complex protein RnfB  55.97 
 
 		 192 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0733084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2137  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.04 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2487  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  57.03 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1716  electron transport complex protein RnfB  55.97 
 
 		 192 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.270473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  57.81 
 
 		 191 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>