More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0672 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  100 
 
 
334 aa  692    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  56.68 
 
 
319 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  56.25 
 
 
310 aa  363  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  56.54 
 
 
310 aa  360  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  56.29 
 
 
330 aa  347  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  55.48 
 
 
332 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  54.13 
 
 
359 aa  345  7e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  53.82 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  53.61 
 
 
333 aa  342  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  53.67 
 
 
310 aa  341  9e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  55.31 
 
 
336 aa  341  9e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  55.26 
 
 
309 aa  339  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  53.8 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  53.31 
 
 
330 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  53.92 
 
 
346 aa  334  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  55.15 
 
 
313 aa  334  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  52.88 
 
 
333 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  52.88 
 
 
333 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  52.88 
 
 
333 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  54.28 
 
 
313 aa  330  3e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  52.51 
 
 
310 aa  328  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  51.44 
 
 
460 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  52.98 
 
 
340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  50.81 
 
 
353 aa  325  7e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
456 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  51.32 
 
 
330 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  51.5 
 
 
348 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  53.95 
 
 
318 aa  322  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  53.85 
 
 
325 aa  322  7e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  51.27 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  52.17 
 
 
318 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  51.67 
 
 
320 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  52.1 
 
 
335 aa  318  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  50.62 
 
 
458 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  51.97 
 
 
318 aa  318  7e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  51.5 
 
 
314 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
316 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  51.5 
 
 
314 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  48.73 
 
 
461 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  52.82 
 
 
319 aa  316  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  48.73 
 
 
461 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  48.84 
 
 
311 aa  316  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  48.96 
 
 
339 aa  315  6e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  52.24 
 
 
327 aa  315  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  50 
 
 
547 aa  315  7e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  50 
 
 
320 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  48.83 
 
 
304 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  51.63 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  48.63 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  52.65 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  53.9 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  47.42 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  51.5 
 
 
311 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  50.64 
 
 
321 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  47.9 
 
 
453 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  52.27 
 
 
348 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  50.32 
 
 
319 aa  311  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  49.19 
 
 
460 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  51.13 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0758  thioredoxin reductase  45.78 
 
 
458 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18111  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  45.45 
 
 
458 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  49.38 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  51.5 
 
 
311 aa  306  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  51.99 
 
 
321 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  51.13 
 
 
325 aa  305  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  47.06 
 
 
457 aa  305  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  51.47 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  49.19 
 
 
361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  51.83 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  49.83 
 
 
311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  47.37 
 
 
308 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  50 
 
 
321 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  53.18 
 
 
325 aa  302  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  48.01 
 
 
331 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  50.5 
 
 
311 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  46.96 
 
 
321 aa  301  1e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  50.62 
 
 
321 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  47.77 
 
 
331 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  47.78 
 
 
314 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  45.6 
 
 
463 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  47.56 
 
 
316 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
362 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  47.25 
 
 
318 aa  300  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  51.61 
 
 
344 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  50.83 
 
 
311 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  50 
 
 
321 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  51.78 
 
 
321 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  48.16 
 
 
304 aa  299  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  48.2 
 
 
323 aa  298  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  46.84 
 
 
321 aa  298  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  51.67 
 
 
325 aa  298  7e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  50.83 
 
 
311 aa  298  9e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1633  thioredoxin reductase  47.79 
 
 
349 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  47.23 
 
 
316 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  50.5 
 
 
314 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  49.35 
 
 
309 aa  297  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  45.93 
 
 
326 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
320 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>