35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0604 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 183 aa  357  6e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  85.25 
 
 		 182 aa  251  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  63.39 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  67.21 
 
 		 173 aa  190  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  57.38 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 162 aa  105  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 158 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  30.05 
 
 		 158 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  29.83 
 
 		 159 aa  87.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2656  transcription factor of MBF1-like protein  27.74 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14374  predicted protein  31.11 
 
 		 104 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 513 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69049  predicted protein  38.46 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8975  predicted protein  33.33 
 
 		 88 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  42.59 
 
 		 264 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>