169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3094 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  85.87 
 
 		 390 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  758    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  73.98 
 
 		 376 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  72.36 
 
 		 376 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  74.32 
 
 		 375 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  71.35 
 
 		 375 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  70.46 
 
 		 379 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  51.71 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  51.1 
 
 		 356 aa  326  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  51.69 
 
 		 369 aa  315  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  46.86 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  53.04 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  47.13 
 
 		 366 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  44.18 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  49.45 
 
 		 367 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  48.36 
 
 		 367 aa  291  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  50.68 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  43.82 
 
 		 367 aa  286  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  50.84 
 
 		 361 aa  285  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  42.98 
 
 		 377 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  50.42 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  45.27 
 
 		 363 aa  275  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  47.85 
 
 		 364 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  42.37 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  42.09 
 
 		 365 aa  258  9e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  42.9 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  43.47 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  45.98 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  39.94 
 
 		 366 aa  252  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  42.66 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  43.09 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  35.59 
 
 		 349 aa  245  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  39.11 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  45.35 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  45.91 
 
 		 371 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  38.21 
 
 		 461 aa  233  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  44.31 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  40.63 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  33.91 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  42.82 
 
 		 351 aa  229  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  38.04 
 
 		 449 aa  229  7e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  45.93 
 
 		 353 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  41.03 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  48.41 
 
 		 351 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  41.03 
 
 		 324 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  33.92 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  31.59 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.84 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  31.75 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  33.23 
 
 		 393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  30.2 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30.26 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  32.62 
 
 		 504 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  35 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  31.12 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  32.8 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  30.85 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  30.77 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  30.73 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  27.78 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  27.59 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  31.81 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  30.05 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  31.35 
 
 		 393 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  30.68 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  28.41 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  30.42 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  28.12 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  31.43 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  28.53 
 
 		 410 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  29.78 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  31.13 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.65 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  25.87 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  32.81 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  28.65 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  30.15 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  28.49 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  31.03 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  30.26 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.02 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  30.08 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  29.69 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  28.38 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  29.75 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  30.61 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  29.63 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  27.71 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  29.14 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  29.14 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  29.14 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  29.14 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  29.14 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  29.14 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  29.14 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.68 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  30.67 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  28.27 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>