More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2163 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  100 
 
 
284 aa  564  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  62.91 
 
 
275 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  63.81 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  63 
 
 
274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  59.02 
 
 
275 aa  298  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  52.24 
 
 
495 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  47.87 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  49.63 
 
 
248 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
277 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  35.33 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  43.18 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  42.22 
 
 
263 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  40.88 
 
 
254 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32.45 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  40.58 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  37.58 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  39.1 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  30.07 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  31.01 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  31.01 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  31.01 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  32.57 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  39.1 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  37.42 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  30.38 
 
 
251 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  29.75 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.08 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  43.28 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  36.69 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  44.19 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  29.11 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  39.57 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.72 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  28.93 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  40.27 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  45.19 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.7 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  32.64 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  37.96 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  40.65 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  43.08 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  41.04 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  37.23 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  35.51 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  34.44 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  35.29 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  35.1 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  35.1 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  42.97 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  35.1 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.49 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  25.95 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  44.35 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  27.01 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  36.72 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
276 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  35.5 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 
239 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  28.72 
 
 
341 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
256 aa  59.3  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  33.8 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  32.89 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  35.9 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  28.33 
 
 
269 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.77 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  33.55 
 
 
249 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
257 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  29.05 
 
 
341 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  36.27 
 
 
258 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  28.87 
 
 
310 aa  55.8  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
243 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28 
 
 
252 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3123  hypothetical protein  24.74 
 
 
189 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  38.28 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  22.98 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.17 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>