More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1330 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  65.2 
 
 
257 aa  321  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  58.85 
 
 
260 aa  281  9e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  59.66 
 
 
236 aa  278  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  55.32 
 
 
236 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  57.35 
 
 
231 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  39.91 
 
 
250 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  51.92 
 
 
244 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  40.85 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.74 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.29 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  37.39 
 
 
235 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  39.75 
 
 
239 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  37.39 
 
 
235 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  36.94 
 
 
238 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  36.49 
 
 
235 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
241 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.38 
 
 
234 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  37.97 
 
 
233 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.47 
 
 
243 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  40.17 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  40.43 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  39.74 
 
 
246 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  40.17 
 
 
243 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  36.21 
 
 
259 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  36.21 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  32 
 
 
241 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  37.95 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  37.95 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.44 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  28.7 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  38 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
284 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  32.05 
 
 
292 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  32 
 
 
244 aa  88.6  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  34.45 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  37.04 
 
 
312 aa  85.9  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
232 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  31.36 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  27.19 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  31.36 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.36 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  31.36 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  31.36 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  31.36 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.05 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  41.9 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  27.08 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  27.27 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  43.3 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  26.94 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.46 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  27.4 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  30.3 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  39.83 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  30.3 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  33.61 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  32.83 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  42.42 
 
 
275 aa  79  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  27.32 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  26.7 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  26.7 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  26.7 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  26.8 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  30.9 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  35.02 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  43.64 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.55 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  30 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.1 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  38.28 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  27.37 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  34.54 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  45.54 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>