191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0520 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  54.93 
 
 		 292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  54.26 
 
 		 288 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  53.71 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  53.87 
 
 		 290 aa  291  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  51.8 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  50.71 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  50.35 
 
 		 288 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  49.64 
 
 		 288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  52.5 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  47.14 
 
 		 296 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  51.43 
 
 		 295 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  48.21 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  51.43 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  50.55 
 
 		 288 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  50.18 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  49.82 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  45.39 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  46.35 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  47.86 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  46.04 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  46.76 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  48.56 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  47.04 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  42.91 
 
 		 287 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  46.79 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  41.3 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  42.55 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  37.28 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  37.77 
 
 		 285 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  39.19 
 
 		 410 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  38.41 
 
 		 283 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  33.11 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  36.53 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  35.69 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  35.61 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  32.25 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  33.22 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  35.66 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  33.09 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  34.65 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  34.3 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  33.83 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  35.12 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.57 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 		 380 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  31.44 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  31.69 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  32.97 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  33.09 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  31.67 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  34.17 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  32.27 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.63 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  33.46 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.95 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  32.08 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  32.76 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  31.14 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.74 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  36.26 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  36.96 
 
 		 212 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.36 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  34.17 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  30.88 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  32.39 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  29.68 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  33.02 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  30.53 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  31.44 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  28.72 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  35.51 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1446  transcriptional regulator, XRE family  29.75 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0731579  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  32.27 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36600  Helix-turn-helix protein  30.45 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0503658  normal  0.196065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1472  hypothetical protein  30.42 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  29.96 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>