179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1472 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1472  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  590  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  46.04 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0632  helix-turn-helix domain-containing protein  39.08 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  38.08 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  37.72 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  32.93 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  33.68 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  35.23 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  35.32 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  35.19 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.74 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  32.73 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  33.22 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  32.3 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  34.93 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  34.15 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  33.45 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  31.91 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  33.58 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  32.52 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  34.54 
 
 		 282 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  31.45 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  38.84 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  32.63 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  30.57 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  32.33 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.93 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  32.44 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  30.45 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  32.8 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  32.84 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  32.01 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  33.68 
 
 		 300 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  34.5 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  32.3 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  32.13 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  32 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.27 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  32.39 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  29.97 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  30.42 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  30.83 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  30.9 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  32.3 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  28.76 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  30.74 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  32.79 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  29.79 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  28.28 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  31.8 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  28.34 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  32.87 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  28.83 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  32.25 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  31.73 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  30.04 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  31.42 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  30.64 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  31.3 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.91 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.74 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.8 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  31.84 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  31.84 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  27.82 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4907  helix-turn-helix domain-containing protein  28.8 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  29.59 
 
 		 301 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1446  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0731579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  29.96 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  28.78 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  30.15 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  27.44 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  25.09 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  26.05 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.69 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>