More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4185 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
307 aa  608  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  47.81 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  45.08 
 
 
300 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 
366 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  45.63 
 
 
335 aa  155  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
318 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  30.34 
 
 
320 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
336 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
328 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  27.92 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  27.5 
 
 
339 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
345 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
841 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
337 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
822 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
836 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  35.02 
 
 
352 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
331 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
841 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
343 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 
476 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  29.67 
 
 
320 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
353 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
355 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
332 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
359 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  28.62 
 
 
348 aa  99.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.35 
 
 
838 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  27.27 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
346 aa  96.3  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  26.75 
 
 
358 aa  95.9  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  26.12 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 
472 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
337 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
298 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  25.62 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  31.58 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 
337 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
401 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
350 aa  89  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  25.62 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
308 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
358 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.11 
 
 
322 aa  86.3  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
345 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
1739 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
1340 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  32.09 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
1267 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.55 
 
 
2401 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
557 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  27.09 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
679 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  21.22 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
1267 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0513  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.0426124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.04 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.61 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
624 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  22.7 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  29.2 
 
 
954 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>