More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1688 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
380 aa  731  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  60.99 
 
 
409 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  62.79 
 
 
414 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  65.62 
 
 
406 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  60.05 
 
 
421 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  58.7 
 
 
409 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  59.69 
 
 
410 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  60 
 
 
417 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  56.66 
 
 
407 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  60 
 
 
417 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  60 
 
 
417 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  59.38 
 
 
419 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  54.74 
 
 
406 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  61.04 
 
 
419 aa  358  1e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  54.95 
 
 
420 aa  355  7e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  56.51 
 
 
429 aa  355  9e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  51.3 
 
 
419 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  55.76 
 
 
403 aa  345  9e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  59.12 
 
 
432 aa  344  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  57.52 
 
 
306 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  57.52 
 
 
306 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  48.3 
 
 
410 aa  284  2e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  41.73 
 
 
405 aa  252  9e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  41.85 
 
 
411 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  38.06 
 
 
412 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  39.63 
 
 
410 aa  249  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  37.02 
 
 
410 aa  243  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  37.43 
 
 
410 aa  242  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  39.21 
 
 
406 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  41.58 
 
 
418 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  39.68 
 
 
408 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  39.12 
 
 
405 aa  239  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  41.3 
 
 
418 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  40.76 
 
 
404 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  39.56 
 
 
398 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.52134e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  38.8 
 
 
404 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  41.03 
 
 
404 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  40.76 
 
 
415 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  40.76 
 
 
404 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  39.12 
 
 
405 aa  235  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  37.86 
 
 
413 aa  235  1e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  38.86 
 
 
405 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  38.42 
 
 
438 aa  233  4e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  38.86 
 
 
404 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  40.87 
 
 
429 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  40.27 
 
 
404 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  39.1 
 
 
429 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  38.16 
 
 
404 aa  225  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  51.27 
 
 
297 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  36.41 
 
 
398 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  47.47 
 
 
297 aa  209  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  37.81 
 
 
404 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  54.37 
 
 
223 aa  201  2e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  37.85 
 
 
411 aa  197  2e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  47.96 
 
 
400 aa  196  5e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 
400 aa  192  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  35.36 
 
 
400 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  55.14 
 
 
213 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  48.13 
 
 
284 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  58.33 
 
 
216 aa  189  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  45.93 
 
 
279 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  52.85 
 
 
225 aa  186  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  54.17 
 
 
234 aa  185  1e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 
302 aa  185  1e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  43.57 
 
 
299 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  46.64 
 
 
307 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  48.03 
 
 
240 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  41.94 
 
 
306 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 
322 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  46.73 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  46.73 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  42.31 
 
 
435 aa  179  5e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  46.26 
 
 
322 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2319  phosphoserine phosphatase SerB  55.33 
 
 
213 aa  179  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  45.92 
 
 
325 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 
326 aa  175  1e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  49.3 
 
 
292 aa  175  1e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  50.99 
 
 
278 aa  175  1e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  47.19 
 
 
281 aa  175  1e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  49.51 
 
 
285 aa  174  2e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  47.83 
 
 
322 aa  174  2e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  36.81 
 
 
357 aa  175  2e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  37.89 
 
 
326 aa  173  4e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  45.06 
 
 
325 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  43.84 
 
 
306 aa  173  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  46.34 
 
 
276 aa  172  8e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  38.21 
 
 
317 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  44.66 
 
 
215 aa  172  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  49.02 
 
 
285 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  44.25 
 
 
322 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>