More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2905 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
712 aa  1413    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  49.56 
 
 
718 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  46.46 
 
 
731 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  43.87 
 
 
716 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  40.18 
 
 
691 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  38.39 
 
 
691 aa  472  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  37.77 
 
 
701 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 
698 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  40.76 
 
 
691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  38.83 
 
 
719 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  34.96 
 
 
696 aa  433  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  36.2 
 
 
698 aa  372  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  34.97 
 
 
718 aa  359  9e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 
752 aa  354  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  33.62 
 
 
710 aa  345  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
971 aa  343  8e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  33.67 
 
 
693 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0966  heavy metal translocating P-type ATPase  33.99 
 
 
722 aa  340  4e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000592542  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  32.72 
 
 
699 aa  330  4e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0498  heavy metal translocating P-type ATPase  37.83 
 
 
700 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  30.94 
 
 
691 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  33.19 
 
 
695 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06700  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
702 aa  317  6e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000434785  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  34.1 
 
 
703 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
747 aa  313  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  31.19 
 
 
702 aa  309  9e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  27.44 
 
 
698 aa  306  8.000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  32.27 
 
 
693 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  31.94 
 
 
770 aa  293  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  32.82 
 
 
718 aa  293  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  31.05 
 
 
723 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  35.07 
 
 
734 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  30.88 
 
 
743 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  30.83 
 
 
805 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  37.38 
 
 
835 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  29.76 
 
 
755 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  34.09 
 
 
670 aa  275  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.4 
 
 
798 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  29.12 
 
 
737 aa  272  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  35.46 
 
 
637 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  32.96 
 
 
623 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6437  heavy metal translocating P-type ATPase  32.09 
 
 
817 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  33.4 
 
 
817 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  33.4 
 
 
817 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
844 aa  267  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  30.3 
 
 
630 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  30.01 
 
 
766 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  31.27 
 
 
839 aa  266  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.01 
 
 
797 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  35.47 
 
 
787 aa  265  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  33.27 
 
 
804 aa  263  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  33.6 
 
 
828 aa  263  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  29.89 
 
 
833 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  33.52 
 
 
792 aa  260  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  34.77 
 
 
836 aa  259  9e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  34.96 
 
 
838 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  31.96 
 
 
818 aa  259  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  32.01 
 
 
737 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  35.88 
 
 
839 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  32.35 
 
 
758 aa  257  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2844  heavy metal translocating P-type ATPase  30.21 
 
 
872 aa  258  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  33.76 
 
 
628 aa  257  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
639 aa  257  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  35.03 
 
 
740 aa  257  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  36.88 
 
 
715 aa  256  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  32.46 
 
 
820 aa  256  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  34.05 
 
 
806 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  32.94 
 
 
724 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.04 
 
 
814 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  32.48 
 
 
699 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.96 
 
 
833 aa  255  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  28.91 
 
 
634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  32.11 
 
 
792 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  34.24 
 
 
761 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  33.96 
 
 
792 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  32.31 
 
 
644 aa  254  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.79 
 
 
819 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  31.1 
 
 
707 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  32.61 
 
 
828 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  34.27 
 
 
790 aa  254  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
828 aa  253  6e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 
795 aa  253  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  34.84 
 
 
740 aa  253  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 
857 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  31.57 
 
 
814 aa  252  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0489  heavy metal translocating P-type ATPase  33.64 
 
 
751 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  34.9 
 
 
826 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  30.63 
 
 
796 aa  252  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 
833 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.34 
 
 
641 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  31.86 
 
 
645 aa  251  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  28.94 
 
 
819 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0981  cation transport ATPase  29.04 
 
 
633 aa  251  4e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 
846 aa  250  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  34.5 
 
 
840 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  33.77 
 
 
792 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  32.68 
 
 
639 aa  249  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  35.9 
 
 
748 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  32 
 
 
738 aa  249  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  31.5 
 
 
635 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>