175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2404 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  221  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  62.39 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  36.45 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  37.74 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 263 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 263 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  49.3 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  49.3 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  39.45 
 
 		 272 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  40.62 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  37.89 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  25.23 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  41.3 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  33.02 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  35.19 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  33.94 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  30.56 
 
 		 242 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  30.84 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  38.3 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  29.91 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  29.91 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  36.67 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  36.67 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  32.69 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  36.17 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  25.49 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  32.11 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  35 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 258 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 270 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0203  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  45.31 
 
 		 374 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  35.71 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  38.46 
 
 		 268 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  35.06 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 195 aa  52  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  30.28 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  40.32 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  35.06 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2870  molybdate metabolism transcriptional regulator  42.19 
 
 		 372 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 268 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 269 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  30.39 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  32.95 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  34 
 
 		 257 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  35.64 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3707  periplasmic-binding protein  40 
 
 		 361 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  47.95 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  47.95 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  36.84 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 269 aa  50.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 254 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  39.56 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  46.99 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  37.93 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 290 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  40 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  27 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  44.59 
 
 		 254 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  43.48 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  32.97 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  28.72 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3130  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2477  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  37.5 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.497113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 263 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 261 aa  47.4  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>