More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4818 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  100 
 
 		 162 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  100 
 
 		 157 aa  310  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  62.94 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  59.74 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  60.14 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  58.62 
 
 		 162 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  47.44 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  47.4 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  47.44 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  49.28 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  48.65 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.49 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.87 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  38.85 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  38.13 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  41.04 
 
 		 171 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  41.26 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  40.56 
 
 		 181 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  37.41 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  41.26 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.42 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  38.81 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  42.54 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  32.26 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  32.48 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  32.48 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.09 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  37.59 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  39.44 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  35.51 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  35.34 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  44.2 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  38.57 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  36.96 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  43.48 
 
 		 178 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  43.48 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  37.68 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  36.96 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  35.66 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  32.26 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  37.14 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  30.92 
 
 		 180 aa  97.1  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.97 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.27 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  39.1 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.51 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  37.23 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.88 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.51 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  38.13 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.29 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.29 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.29 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  37.68 
 
 		 162 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.29 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  38.41 
 
 		 163 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.51 
 
 		 163 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  34.01 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.57 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.29 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  34.04 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  33.81 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  33.57 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  35.46 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.29 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  34.9 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  34.04 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.57 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.42 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.42 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  37.06 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  34.93 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  34.29 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  34.93 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  35.97 
 
 		 189 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  37.25 
 
 		 212 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  35.97 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  35 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  36.18 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  34.33 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  33.77 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1476  CheW protein  38.57 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.331722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  37.04 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  34.07 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  35.37 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35.71 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  33.77 
 
 		 185 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  36.36 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>