More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5173 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
632 aa  1215    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  75.57 
 
 
595 aa  828    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  92.72 
 
 
630 aa  1067    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  76.43 
 
 
597 aa  828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  92.88 
 
 
630 aa  1071    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  79.36 
 
 
629 aa  882    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  57.44 
 
 
594 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  51.53 
 
 
608 aa  548  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  48.01 
 
 
591 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  47.46 
 
 
593 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  46.91 
 
 
592 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  47.15 
 
 
591 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  42 
 
 
594 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  44.58 
 
 
583 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  42.64 
 
 
594 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  40.37 
 
 
583 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  45.28 
 
 
577 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  41.86 
 
 
594 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  41.05 
 
 
574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  42.83 
 
 
578 aa  356  7.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  42.22 
 
 
590 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  35.52 
 
 
569 aa  340  7e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.51 
 
 
568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.97 
 
 
605 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  35.87 
 
 
601 aa  332  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  38.05 
 
 
668 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.68 
 
 
572 aa  330  4e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  35.54 
 
 
601 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  36.38 
 
 
649 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  34.18 
 
 
662 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
668 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
668 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
668 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  37.99 
 
 
678 aa  324  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.89 
 
 
605 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  34.95 
 
 
628 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  34.78 
 
 
628 aa  322  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.02 
 
 
607 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.43 
 
 
602 aa  321  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  36.56 
 
 
620 aa  320  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.56 
 
 
620 aa  320  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.56 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.56 
 
 
620 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.56 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  36.56 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.56 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.56 
 
 
620 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.56 
 
 
620 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.88 
 
 
602 aa  316  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  38.7 
 
 
663 aa  316  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.88 
 
 
602 aa  316  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.88 
 
 
602 aa  316  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  36.35 
 
 
667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.23 
 
 
621 aa  315  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  35.43 
 
 
650 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.19 
 
 
669 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  39.19 
 
 
669 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.19 
 
 
669 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.19 
 
 
669 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.19 
 
 
669 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.81 
 
 
604 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.01 
 
 
669 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  38.22 
 
 
663 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.81 
 
 
617 aa  313  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
670 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  37.54 
 
 
603 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.12 
 
 
602 aa  311  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.85 
 
 
600 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
670 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  35.03 
 
 
648 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0944  potassium efflux system protein  36.15 
 
 
610 aa  310  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.728384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  34.97 
 
 
648 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  34.97 
 
 
648 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  35.24 
 
 
616 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  37.22 
 
 
667 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  35.95 
 
 
649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.45 
 
 
613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
649 aa  308  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  37.22 
 
 
666 aa  308  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  35.6 
 
 
649 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  34.3 
 
 
648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  35.37 
 
 
589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.52 
 
 
680 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  34.98 
 
 
660 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 
661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  36.36 
 
 
661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  37.89 
 
 
533 aa  305  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.28 
 
 
613 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  33.06 
 
 
648 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.92 
 
 
654 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.55 
 
 
620 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.99 
 
 
602 aa  303  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  35.84 
 
 
652 aa  303  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 
653 aa  303  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  32.89 
 
 
648 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.55 
 
 
627 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.39 
 
 
620 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  37.3 
 
 
659 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.32 
 
 
620 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51113  CPA2 family transporter: potassium ion efflux  39.13 
 
 
593 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0882446  normal  0.0997387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>