142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1031 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1031  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
386 aa  752    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.819756  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2766  sodium/hydrogen exchanger  43.54 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1458  sodium/hydrogen exchanger  41.87 
 
 
386 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 
412 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  24.59 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.93 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.93 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.93 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.93 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.93 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.93 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.65 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.65 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.2 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.38 
 
 
387 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.93 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.73 
 
 
609 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.92 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.92 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.92 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.92 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.92 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  22.97 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  23.92 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  22.7 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.73 
 
 
609 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  22.7 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  22.7 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  22.7 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  22.7 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  22.7 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.12 
 
 
609 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.46 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  24.29 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  22.16 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  26.63 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.4 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  24.53 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 
767 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
530 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  23.94 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  33.04 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  33.04 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  21.93 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  21.93 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  21.93 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  32.17 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  25.8 
 
 
399 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  24.13 
 
 
445 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  25.72 
 
 
382 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  28.27 
 
 
423 aa  62.8  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  25.86 
 
 
715 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  23.93 
 
 
614 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  23.93 
 
 
614 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  24.07 
 
 
388 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 
751 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  24.28 
 
 
614 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
712 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  24.34 
 
 
715 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 
406 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  23.62 
 
 
419 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  25.45 
 
 
756 aa  57.4  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  26.18 
 
 
951 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  25.3 
 
 
683 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  29.19 
 
 
385 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  32.88 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.47 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 
389 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  22.37 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  22.92 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 
716 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30 
 
 
484 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  21.45 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 
732 aa  53.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  30 
 
 
484 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  24.74 
 
 
414 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  25.9 
 
 
698 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  24.1 
 
 
424 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  24.41 
 
 
452 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  22.25 
 
 
611 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  28.31 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4412  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4003  Na+/H+ antiporter  48.98 
 
 
73 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  25.9 
 
 
404 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1412  sodium/hydrogen exchanger  23.88 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2064  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
507 aa  50.8  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  25.28 
 
 
429 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.66 
 
 
750 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>