More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7752 on replicon NC_011889
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011889  Mnod_7752  Resolvase domain protein  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  85.65 
 
 		 211 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5372  Resolvase domain  78.17 
 
 		 210 aa  290  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  69.38 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2441  putative recombinase, transposition resolvase, TnpR  40.84 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3315  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  39.5 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  39.29 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  39.29 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  37.37 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  37.37 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  36.18 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  31.31 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  37.7 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  35.6 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  32.99 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  35.35 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  35.53 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  35.6 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  34.67 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  35.6 
 
 		 186 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  35.6 
 
 		 186 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  35.6 
 
 		 186 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  36.55 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  30.96 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  36.04 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  30.96 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  31.09 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  31.09 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  31.09 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  35.6 
 
 		 185 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  35.6 
 
 		 185 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  35.6 
 
 		 185 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  35.6 
 
 		 185 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  35.6 
 
 		 185 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.09 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  30.96 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  33.67 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  34.41 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  33.86 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  30.57 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  35.08 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  35.08 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  34.34 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  37.43 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  35.26 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  33.68 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  34.03 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  34.38 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  34.38 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  34.2 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  34.03 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  32.46 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  34.72 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  35.9 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  35.6 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  32.98 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  34.21 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  34.74 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  34.36 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  34.36 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  34.74 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  33.16 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  35.26 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  33.85 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  34.85 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  35.08 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  35.08 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  32.82 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  30.89 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.24 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  28.87 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  33.83 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  33.85 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  34.52 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  33.51 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  34.54 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  35 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  30.73 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  35.42 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  33.69 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  39.35 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  34.21 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>