74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2429 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  99.71 
 
 		 342 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 342 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  96.2 
 
 		 342 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  81.76 
 
 		 318 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  82.7 
 
 		 318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  73.51 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  52.43 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  47.21 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  47.94 
 
 		 322 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  47.8 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  44.15 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  46.01 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  41.88 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  44.95 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  38.64 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  41.1 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  44.98 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  39.6 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  38.82 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  39.81 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  41.43 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  42.91 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  42.56 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  36.61 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  39.61 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.54 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  39.03 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  38.14 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  34.16 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  39.06 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  37.01 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  37.41 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  36.88 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.62 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  34.71 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  32.75 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  35.11 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  52.48 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  29.63 
 
 		 622 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.99 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  29.84 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  32.05 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  34.69 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  23.73 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  27.55 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  31.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  23.17 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  29.67 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  32.48 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  50 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  22.48 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  37.78 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  31.62 
 
 		 308 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  31.62 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  28.87 
 
 		 311 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  28.87 
 
 		 311 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  28.87 
 
 		 311 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  28.87 
 
 		 311 aa  46.2  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  29.51 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  25.6 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  34.11 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  30.3 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  30.67 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  30.3 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  28.87 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  26.34 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  27.84 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  32.17 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  27.84 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  27.84 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  29.55 
 
 		 339 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  31.3 
 
 		 308 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>