223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3655 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
199 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  45.98 
 
 
105 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  32.4 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  31.12 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  46.99 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  49.35 
 
 
104 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  29.03 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  29.03 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  29.03 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  29.03 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  29.03 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  29.03 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  29.03 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  29.03 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  31.94 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  31.18 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  30.06 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  29.17 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  30.37 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  28.9 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  28.9 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  28.9 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  28.9 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  46.84 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  29.1 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  29.45 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  29.45 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  29.14 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  29.45 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  46.15 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  40.66 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  47.13 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  47.13 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  28.16 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  32.8 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  31.95 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  30.41 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  40.7 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  32.32 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  40.45 
 
 
100 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  29.82 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  31.71 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  47.89 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  30.16 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  29.31 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  29.82 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 
109 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 
100 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 
89 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 
109 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
100 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  29.82 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  29.82 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  27.32 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  50.75 
 
 
97 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  30.25 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  40.23 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  30.25 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  30.06 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  29.82 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  29.94 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  27.62 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  29.82 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  29.82 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  29.82 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  29.73 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  29.27 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  26.06 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  26.06 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  26.78 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  31.74 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  28.57 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  28.93 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  25.95 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  27.03 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  46.88 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  25.97 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  43.42 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  26.92 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  25.29 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  40.79 
 
 
85 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  29.7 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  28.57 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  29.7 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  34.52 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  37.97 
 
 
88 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 
98 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  36 
 
 
87 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  28.11 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  62.4  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  27.88 
 
 
187 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  41.38 
 
 
98 aa  62  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1330  protein of unknown function YGGT  25.29 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>