More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1467 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  100 
 
 		 603 aa  1211    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43 
 
 		 592 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  39.93 
 
 		 602 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 594 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  39.03 
 
 		 603 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  39.9 
 
 		 602 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  39.4 
 
 		 607 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  39.4 
 
 		 625 aa  415  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  39.05 
 
 		 622 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 600 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  37.81 
 
 		 616 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  39.79 
 
 		 592 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  37.07 
 
 		 600 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  36.45 
 
 		 635 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  41.08 
 
 		 621 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  38.09 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  37.24 
 
 		 603 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  37.54 
 
 		 608 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  36.9 
 
 		 611 aa  385  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  36.65 
 
 		 614 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  36.82 
 
 		 588 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.68 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  35.49 
 
 		 589 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  39.03 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  34.66 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.4 
 
 		 623 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  37.44 
 
 		 610 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.58 
 
 		 590 aa  368  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  36.3 
 
 		 619 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.63 
 
 		 597 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  34.82 
 
 		 588 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.91 
 
 		 614 aa  364  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  35.19 
 
 		 613 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  34.14 
 
 		 584 aa  360  5e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.72 
 
 		 617 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.79 
 
 		 597 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.79 
 
 		 597 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.84 
 
 		 637 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.24 
 
 		 608 aa  356  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  32.99 
 
 		 578 aa  355  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  38.15 
 
 		 598 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  34.72 
 
 		 588 aa  352  8e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  39.55 
 
 		 650 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.45 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  34.7 
 
 		 587 aa  351  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  37.28 
 
 		 610 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  37.28 
 
 		 610 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.19 
 
 		 617 aa  350  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  34.53 
 
 		 587 aa  349  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  37.52 
 
 		 607 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.88 
 
 		 598 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  34.7 
 
 		 587 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  34.11 
 
 		 632 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.7 
 
 		 587 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  38.7 
 
 		 608 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.7 
 
 		 587 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 587 aa  347  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  34.87 
 
 		 587 aa  347  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 587 aa  346  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  35.19 
 
 		 586 aa  346  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  35.19 
 
 		 610 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  35.19 
 
 		 587 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  33.62 
 
 		 591 aa  343  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.36 
 
 		 587 aa  343  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.06 
 
 		 587 aa  343  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  35.46 
 
 		 586 aa  342  8e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  36.32 
 
 		 594 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  36.35 
 
 		 626 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 		 675 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  39.92 
 
 		 622 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  34.97 
 
 		 579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  34.97 
 
 		 579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  35.23 
 
 		 602 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05871  putative multidrug efflux ABC transporter  35.23 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  33.94 
 
 		 632 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  35.31 
 
 		 592 aa  337  3.9999999999999995e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  37.83 
 
 		 598 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.77 
 
 		 625 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  34.63 
 
 		 594 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  36.92 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 642 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  37.21 
 
 		 598 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 620 aa  334  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06171  putative multidrug efflux ABC transporter  35.08 
 
 		 598 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 600 aa  332  8e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  32.76 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.99 
 
 		 609 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 592 aa  331  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06251  putative multidrug efflux ABC transporter  34.12 
 
 		 598 aa  329  9e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.761119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  35.24 
 
 		 626 aa  329  9e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  36.82 
 
 		 599 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  36.33 
 
 		 610 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  36.33 
 
 		 610 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  36.45 
 
 		 645 aa  327  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 598 aa  327  5e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.47 
 
 		 586 aa  326  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  36.33 
 
 		 610 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0561  multidrug ABC transporter  34.95 
 
 		 598 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.793033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.41 
 
 		 586 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  32.92 
 
 		 585 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>