259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1411 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 
924 aa  1919    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  38.97 
 
 
936 aa  617  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  38.62 
 
 
931 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 
898 aa  591  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  37.6 
 
 
899 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  37.78 
 
 
902 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  37.02 
 
 
912 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  36.43 
 
 
914 aa  559  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  36.72 
 
 
931 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.7 
 
 
894 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.64 
 
 
905 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  38.55 
 
 
938 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.11 
 
 
894 aa  552  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  38.33 
 
 
930 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  38.94 
 
 
930 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  38.94 
 
 
930 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  37 
 
 
893 aa  544  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  36.88 
 
 
935 aa  545  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  35.1 
 
 
943 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  37.52 
 
 
928 aa  544  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  37.39 
 
 
928 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  37.39 
 
 
928 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.38 
 
 
900 aa  535  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  36.17 
 
 
933 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  36.65 
 
 
933 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  37.16 
 
 
936 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  37.23 
 
 
935 aa  535  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  35.87 
 
 
934 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  35.57 
 
 
936 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 
953 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  36.12 
 
 
932 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  34.45 
 
 
1029 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  35.09 
 
 
949 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  35.39 
 
 
934 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  35.48 
 
 
899 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  36.35 
 
 
931 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  36.95 
 
 
931 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.32 
 
 
894 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  35.21 
 
 
941 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  35.64 
 
 
934 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  34.45 
 
 
969 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  36.91 
 
 
937 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  37.3 
 
 
925 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  34.12 
 
 
906 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  36.08 
 
 
968 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  35.65 
 
 
989 aa  504  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.69 
 
 
893 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  33.83 
 
 
968 aa  502  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  33.19 
 
 
892 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  35.04 
 
 
912 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  33.75 
 
 
900 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  33.07 
 
 
900 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  32.49 
 
 
900 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  33.07 
 
 
900 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  32.38 
 
 
900 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
889 aa  488  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  32.73 
 
 
900 aa  486  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  35.57 
 
 
881 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  34.7 
 
 
941 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  35.88 
 
 
897 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  32.69 
 
 
899 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  33.07 
 
 
899 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
930 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  34.74 
 
 
859 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.67 
 
 
930 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.59 
 
 
930 aa  473  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  32.45 
 
 
900 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  34.21 
 
 
859 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  34.45 
 
 
877 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  32.18 
 
 
898 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  35.68 
 
 
852 aa  465  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  33.53 
 
 
891 aa  466  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  33.54 
 
 
858 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  33.54 
 
 
858 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  34.05 
 
 
858 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  33.62 
 
 
900 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  35.14 
 
 
857 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  33.54 
 
 
858 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  34.05 
 
 
861 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  33.92 
 
 
858 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  33.45 
 
 
903 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  34.05 
 
 
858 aa  459  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  34.38 
 
 
869 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  35.97 
 
 
850 aa  458  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  33.92 
 
 
858 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  33.92 
 
 
858 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  33.92 
 
 
858 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  33.92 
 
 
858 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  33.92 
 
 
858 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  33.69 
 
 
904 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 
858 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  33.88 
 
 
890 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  33.54 
 
 
858 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  33.54 
 
 
858 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 
858 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  33.26 
 
 
927 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  33.88 
 
 
859 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
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NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  32.07 
 
 
898 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.636582 
 
 
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NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 
862 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  31.99 
 
 
881 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
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