More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0015 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 
461 aa  921    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2412  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.2 
 
 
445 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.874746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03816  ATP-dependent protease ATP-binding subunit  61.64 
 
 
443 aa  551  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4054  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  551  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  551  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5388  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.85 
 
 
443 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3471  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.34 
 
 
457 aa  551  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03765  hypothetical protein  61.64 
 
 
443 aa  551  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  61.85 
 
 
444 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4467  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.42 
 
 
440 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  551  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4421  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732607  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.22 
 
 
443 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4423  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4413  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  551  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0179  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.85 
 
 
443 aa  549  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4491  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.64 
 
 
443 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4793  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.99 
 
 
444 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000260414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.22 
 
 
441 aa  545  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  61.85 
 
 
443 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0165  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.42 
 
 
443 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.7 
 
 
443 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.99 
 
 
443 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.86 
 
 
441 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04279  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.61 
 
 
485 aa  542  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.7 
 
 
443 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.86 
 
 
446 aa  543  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337304  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.7 
 
 
443 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0738  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.09 
 
 
459 aa  541  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4192  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.22 
 
 
443 aa  541  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.17 
 
 
441 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0827  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.09 
 
 
459 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.198289  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001749  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  60.43 
 
 
443 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28369  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.09 
 
 
440 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.43 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2739  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.66 
 
 
444 aa  538  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3798  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  61.21 
 
 
443 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00723  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.86 
 
 
443 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2368  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  60.04 
 
 
440 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.421768  hitchhiker  0.00000674723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0528  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.78 
 
 
442 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.56 
 
 
441 aa  535  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2748  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  60.04 
 
 
440 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0065  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.62 
 
 
466 aa  535  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.215309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.43 
 
 
443 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.14 
 
 
440 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3680  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.12 
 
 
446 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2247  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60 
 
 
443 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3522  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.83 
 
 
442 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.61 
 
 
442 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3700  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.83 
 
 
442 aa  534  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62855  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.14 
 
 
440 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2990  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.69 
 
 
446 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.92 
 
 
442 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2341  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.9 
 
 
447 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.320663  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2546  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.48 
 
 
443 aa  528  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.43 
 
 
448 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0115  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  60.26 
 
 
444 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.928834  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3362  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.19 
 
 
441 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1240  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.46 
 
 
435 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.05 
 
 
443 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.22 
 
 
443 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3868  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.32 
 
 
442 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.4 
 
 
448 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.05 
 
 
443 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2296  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.34 
 
 
435 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.238027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0462  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.32 
 
 
442 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0164  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.97 
 
 
447 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0472  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.32 
 
 
442 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0120  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.09 
 
 
433 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.417089  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.62 
 
 
446 aa  528  1e-148  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0069  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.61 
 
 
447 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234013  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.48 
 
 
447 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.67 
 
 
483 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0811  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.4 
 
 
438 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3765  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.71 
 
 
441 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0909  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.78 
 
 
442 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0072  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.26 
 
 
447 aa  519  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0695  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.96 
 
 
441 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0678  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.96 
 
 
441 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.01 
 
 
433 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.768224  normal  0.321326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4560  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.32 
 
 
441 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6442  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.19 
 
 
447 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377581  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.43 
 
 
440 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000086324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1612  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.8 
 
 
441 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4381  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.53 
 
 
448 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0003  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.58 
 
 
444 aa  518  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.834513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.35 
 
 
439 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0500755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0556  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  57.85 
 
 
474 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1542  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.49 
 
 
443 aa  521  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.26 
 
 
465 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2079  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.76 
 
 
434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.94 
 
 
446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0403  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.4 
 
 
433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.236378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0302  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.05 
 
 
434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0031  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.46 
 
 
435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3092  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.05 
 
 
447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.486059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>