39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0984 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  89.22 
 
 		 269 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  85.87 
 
 		 269 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  65.8 
 
 		 269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  28.99 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.31 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  29.56 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  29.3 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  26.49 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  26.61 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.21 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  27.43 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.61 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.19 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.47 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  23.11 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  23.77 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  21.89 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  21.62 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  23.32 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  23.04 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  23.91 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  22.89 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.44 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  28.42 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  22.81 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  23.89 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  24.31 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  27.39 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1119  xylose isomerase domain-containing protein  23.32 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  25.97 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  21.51 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  24.68 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.07 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  20.69 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.69 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  21.56 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  24 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>