39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00280 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  624  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  72.56 
 
 
317 aa  412  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  46.09 
 
 
305 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  38.13 
 
 
746 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  38.13 
 
 
746 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.71 
 
 
970 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.71 
 
 
970 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  32.34 
 
 
667 aa  79.7  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.4 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.21 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  31.82 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.42 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  31.71 
 
 
402 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  31.17 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  37.59 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  32 
 
 
955 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  31.16 
 
 
749 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.13 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  31.17 
 
 
717 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  31.25 
 
 
717 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.17 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.03 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.87 
 
 
717 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  29.87 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  29.87 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  25.48 
 
 
746 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.39 
 
 
599 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  31.85 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.5 
 
 
1006 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  35.25 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.29 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  34.62 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.06 
 
 
201 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.06 
 
 
201 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.57 
 
 
206 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  33.33 
 
 
666 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  30.91 
 
 
695 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.87 
 
 
223 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.45 
 
 
1002 aa  43.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>