More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2505 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.93 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  58.82 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  56.7 
 
 		 227 aa  269  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  56.7 
 
 		 227 aa  269  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  57.66 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  54.09 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  54.3 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3685  two component transcriptional regulator  58.11 
 
 		 223 aa  244  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  54.05 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  54.95 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 227 aa  237  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 227 aa  237  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4025  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  50.23 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  51.58 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  51.82 
 
 		 230 aa  228  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 223 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  52.29 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4200  two-component response regulator PhoP  51.83 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  50.23 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  53.21 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 222 aa  224  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0166  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  53.21 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2935  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000047512  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4212  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000202187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4344  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 		 231 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000925591  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4140  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 		 231 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 223 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 223 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  52.75 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  51.83 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1388  transcriptional regulatory protein PhoP  49.55 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  52.29 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1679  transcriptional regulatory protein PhoP, putative  52.29 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3709  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.29 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 224 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  48.43 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  50.91 
 
 		 223 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 257 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  50 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  55.45 
 
 		 223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3381  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.060909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.51 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2804  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000183823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3772  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  52.97 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2543  putative two-component response regulator  53.18 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0177943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 221 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 224 aa  197  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1995  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1850  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0826767  hitchhiker  0.000859255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2501  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1746  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000480188  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2494  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.178511  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2614  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0312  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1542  response regulator receiver protein  46.4 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1580  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 227 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.128837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1655  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 227 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  hitchhiker  0.000274191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29730  putative two-component response regulator  51.54 
 
 		 223 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>