105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1317 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  100 
 
 
279 aa  585  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  45.96 
 
 
278 aa  260  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  42.97 
 
 
279 aa  228  7e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  44.4 
 
 
280 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  41.52 
 
 
302 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  37.28 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  41.92 
 
 
278 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  40.09 
 
 
291 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  35.16 
 
 
274 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
287 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  39.91 
 
 
293 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  35.47 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  36.91 
 
 
319 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  36.4 
 
 
291 aa  158  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  30.69 
 
 
291 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  36.24 
 
 
293 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  27.44 
 
 
274 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  34.2 
 
 
279 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  28.68 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  31.82 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  30.71 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  27.85 
 
 
277 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  22.76 
 
 
286 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  22.76 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  30.41 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  26.64 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  27.68 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.61 
 
 
269 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  30.3 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  23.02 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  26.04 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  28 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  29.01 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  25 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  28.78 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  24.1 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  26.18 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  32.43 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  25.85 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  25.34 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  27.52 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  28.33 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  24.87 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  30.41 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  29.73 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  27.13 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  24.81 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  29.81 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  28.97 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  23.3 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  29.45 
 
 
256 aa  59.7  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  22.67 
 
 
302 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  25.79 
 
 
289 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  21.13 
 
 
191 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  22.49 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  34.65 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  26.89 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  23.32 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.78 
 
 
352 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  34.83 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  34.65 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  23.04 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  25.97 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  28 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.57 
 
 
209 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  28 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  27.13 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  25.42 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  28 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  35.9 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 
218 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  24.27 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.17 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  35.63 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.22 
 
 
232 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  22.22 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  30.69 
 
 
249 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  35.9 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  22.98 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  29.55 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 
204 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  25 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  32.05 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.25 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
207 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2350  methyltransferase type 11  25.21 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.67 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5724  methyltransferase type 11  27.55 
 
 
143 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262167  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  25.85 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>