40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1115 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  672    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  47.92 
 
 
352 aa  349  5e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  45 
 
 
346 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  43.58 
 
 
338 aa  299  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  45.4 
 
 
366 aa  293  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  42.14 
 
 
347 aa  280  4e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  40.36 
 
 
347 aa  246  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  34.26 
 
 
348 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  34.04 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  32.25 
 
 
344 aa  176  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  30.91 
 
 
342 aa  169  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  33.73 
 
 
340 aa  160  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  35.59 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  27.55 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.29 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  27.81 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  26.72 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  23.4 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  21.94 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  24.56 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  24.49 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  21.93 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  22.51 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  24.29 
 
 
345 aa  56.6  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  24.09 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  21.35 
 
 
330 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  21.82 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  23.05 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  26.39 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  21.94 
 
 
332 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  27.52 
 
 
358 aa  46.2  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  20.9 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.31 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  22.06 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  21.52 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  22.88 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  23.3 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  20.92 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.94 
 
 
340 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  20.92 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>