More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4483 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  84.82 
 
 
225 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  85.25 
 
 
231 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  85.25 
 
 
231 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  85.25 
 
 
231 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  76.82 
 
 
236 aa  351  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  69.12 
 
 
227 aa  315  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  66.96 
 
 
309 aa  310  8e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  67.74 
 
 
235 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  65.38 
 
 
250 aa  309  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  70.05 
 
 
240 aa  307  9e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  72.64 
 
 
229 aa  305  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  71.69 
 
 
248 aa  304  8e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  68.04 
 
 
225 aa  290  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  61.09 
 
 
252 aa  288  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  66.67 
 
 
283 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  64.55 
 
 
239 aa  284  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  62.28 
 
 
236 aa  281  8e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07400  NADH dehydrogenase subunit C  63.4 
 
 
253 aa  280  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0403286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  65.71 
 
 
245 aa  275  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  61.01 
 
 
246 aa  268  6e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  62.86 
 
 
245 aa  268  6e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  59.47 
 
 
253 aa  265  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  60.85 
 
 
252 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.73 
 
 
245 aa  260  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  60.56 
 
 
213 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  57.55 
 
 
275 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  59.72 
 
 
229 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  64.48 
 
 
192 aa  234  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  58.8 
 
 
236 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.17 
 
 
174 aa  129  4e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  44.08 
 
 
199 aa  127  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  44.08 
 
 
199 aa  125  4e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.45 
 
 
179 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.65 
 
 
174 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.71 
 
 
215 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.2 
 
 
166 aa  119  4e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.04 
 
 
230 aa  119  5e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.03 
 
 
171 aa  116  2e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.12 
 
 
215 aa  117  2e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.69 
 
 
197 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.94 
 
 
165 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  41.13 
 
 
162 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  37.36 
 
 
227 aa  114  1e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  36.81 
 
 
227 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  40.79 
 
 
200 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  41.45 
 
 
200 aa  112  4e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.45 
 
 
161 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62434e-29 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  41.45 
 
 
200 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  41.46 
 
 
166 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  40.79 
 
 
200 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  40.79 
 
 
200 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.38 
 
 
209 aa  111  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.45 
 
 
161 aa  111  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  40.79 
 
 
200 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.01 
 
 
162 aa  111  1e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.03894e-05  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  43.08 
 
 
200 aa  110  2e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.38 
 
 
190 aa  110  2e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.67 
 
 
172 aa  110  2e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.38 
 
 
219 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1244  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.87 
 
 
173 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2285  NADH dehydrogenase subunit C  40.13 
 
 
200 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  5.12824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.94 
 
 
215 aa  109  4e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1265  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.46 
 
 
202 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  40.38 
 
 
200 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  40.13 
 
 
200 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.28577e-05  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  37.5 
 
 
200 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1494  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  39.53 
 
 
599 aa  108  7e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  37.58 
 
 
213 aa  108  8e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1495  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.87 
 
 
202 aa  108  9e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.74 
 
 
219 aa  108  9e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2440  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.85 
 
 
600 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.98 
 
 
174 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1366  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.85 
 
 
600 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.4 
 
 
212 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02211  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain C,D  38.85 
 
 
600 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02171  hypothetical protein  38.85 
 
 
600 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2662  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.85 
 
 
600 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0464288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1371  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.85 
 
 
600 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0159293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3425  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.85 
 
 
600 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.022536  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2435  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.85 
 
 
600 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2579  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.85 
 
 
600 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144655  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.38 
 
 
219 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3130  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.4 
 
 
592 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.43 
 
 
164 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  38.22 
 
 
201 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2770  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  39.53 
 
 
599 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1345  NADH dehydrogenase subunit C  38.82 
 
 
200 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229518  hitchhiker  0.00575892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1396  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.37 
 
 
599 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3212  NADH dehydrogenase subunit C  38.82 
 
 
200 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.61 
 
 
182 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  36.88 
 
 
200 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  35.85 
 
 
208 aa  104  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 
200 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0923  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.91 
 
 
213 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  41.61 
 
 
201 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1456  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.22 
 
 
598 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1562  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.22 
 
 
598 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905378  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  39.26 
 
 
281 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0959  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.57 
 
 
202 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>