137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4014 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  68.9 
 
 
497 aa  639  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  947  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  60.77 
 
 
513 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  60.62 
 
 
495 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  60.16 
 
 
518 aa  541  1e-152  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  46.52 
 
 
493 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  46.39 
 
 
492 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  46.27 
 
 
492 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  45.49 
 
 
489 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  46.27 
 
 
492 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  46.19 
 
 
490 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  46.43 
 
 
473 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  47.32 
 
 
473 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  46.43 
 
 
473 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  47.02 
 
 
444 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  48.27 
 
 
508 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  48.37 
 
 
510 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  47.02 
 
 
444 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  45.58 
 
 
442 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  48.05 
 
 
508 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  45.72 
 
 
446 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  45.58 
 
 
442 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  46.33 
 
 
444 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  48.67 
 
 
511 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  46.67 
 
 
507 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  46.67 
 
 
507 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  46.84 
 
 
519 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  47.58 
 
 
552 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  48.74 
 
 
448 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  45.72 
 
 
507 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  46.38 
 
 
501 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  48.24 
 
 
448 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  45.72 
 
 
507 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  45.72 
 
 
507 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  46.84 
 
 
519 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  47.69 
 
 
447 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  46.3 
 
 
507 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  45.61 
 
 
506 aa  357  2e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  44.16 
 
 
454 aa  330  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  43.11 
 
 
451 aa  328  1e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  44.04 
 
 
499 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  44.5 
 
 
454 aa  308  1e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  44.55 
 
 
355 aa  243  4e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  46.56 
 
 
317 aa  241  3e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  49.38 
 
 
239 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  48.21 
 
 
240 aa  202  1e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  35.45 
 
 
593 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  35.81 
 
 
524 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  31.6 
 
 
540 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  31.87 
 
 
532 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  33.24 
 
 
551 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  31.54 
 
 
531 aa  187  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  32.71 
 
 
553 aa  186  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  32.82 
 
 
437 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  34.18 
 
 
534 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  32.99 
 
 
533 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  29.92 
 
 
561 aa  121  2e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  28.92 
 
 
442 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  30.11 
 
 
546 aa  116  1e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  52.04 
 
 
158 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  29.59 
 
 
469 aa  112  1e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  27.72 
 
 
432 aa  109  8e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  32.16 
 
 
387 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  27.75 
 
 
485 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  28.13 
 
 
572 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  34.67 
 
 
469 aa  96.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  50.57 
 
 
87 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  50.57 
 
 
87 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  31.86 
 
 
661 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  50.59 
 
 
87 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  27.14 
 
 
408 aa  79.3  1e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  34.97 
 
 
627 aa  78.6  2e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  28.74 
 
 
407 aa  78.6  2e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  33.53 
 
 
391 aa  78.2  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  40.18 
 
 
260 aa  76.6  8e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.87 
 
 
413 aa  73.9  5e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  37.5 
 
 
222 aa  70.9  5e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  37.76 
 
 
494 aa  69.3  1e-10  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  3.78313e-06  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  34.16 
 
 
433 aa  68.2  3e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  34.16 
 
 
428 aa  67.8  4e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  34.16 
 
 
428 aa  67.8  4e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  33.75 
 
 
433 aa  67.4  5e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  35.77 
 
 
464 aa  67  7e-10  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  33.75 
 
 
428 aa  65.9  1e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  24.82 
 
 
418 aa  66.2  1e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  25.26 
 
 
414 aa  65.5  2e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  33.75 
 
 
433 aa  65.5  2e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  33.75 
 
 
440 aa  64.3  4e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  40.18 
 
 
222 aa  63.9  5e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  33.75 
 
 
436 aa  64.3  5e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  3.88947e-05  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  24.13 
 
 
418 aa  63.9  5e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  34.06 
 
 
566 aa  60.8  5e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  24.76 
 
 
414 aa  59.7  1e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  24.82 
 
 
526 aa  59.7  1e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  24.38 
 
 
417 aa  56.6  9e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  24.63 
 
 
505 aa  55.5  2e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  35.35 
 
 
441 aa  54.7  3e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  31.65 
 
 
508 aa  54.7  3e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  28.1 
 
 
522 aa  54.7  4e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  34.74 
 
 
458 aa  53.9  6e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>