104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3848 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  651  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  78.59 
 
 
330 aa  527  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  63.24 
 
 
332 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  61.16 
 
 
330 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  60.86 
 
 
330 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  60.86 
 
 
330 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  64 
 
 
330 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  64 
 
 
330 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  64 
 
 
330 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  60 
 
 
318 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  60 
 
 
318 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  60 
 
 
318 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  51.07 
 
 
328 aa  272  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  49.85 
 
 
325 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  1.36256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  39.62 
 
 
297 aa  175  1e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  39.25 
 
 
279 aa  174  2e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  38.91 
 
 
342 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  38.32 
 
 
273 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  38.17 
 
 
332 aa  163  4e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  38.51 
 
 
335 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  38.51 
 
 
335 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  37.65 
 
 
331 aa  162  8e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  38.51 
 
 
335 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  35.71 
 
 
327 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  40.33 
 
 
382 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  36.67 
 
 
325 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  36.67 
 
 
325 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  36.67 
 
 
325 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  36.96 
 
 
327 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  37.99 
 
 
331 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  39.02 
 
 
380 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  34.25 
 
 
361 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  35.19 
 
 
349 aa  142  1e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  36.16 
 
 
335 aa  141  1e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  36.42 
 
 
344 aa  142  1e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  37.07 
 
 
271 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  36.11 
 
 
343 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  35.47 
 
 
343 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  35 
 
 
335 aa  131  1e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  35.17 
 
 
343 aa  130  2e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  35.47 
 
 
343 aa  130  2e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  35.17 
 
 
343 aa  130  2e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  35.17 
 
 
343 aa  130  2e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  35.17 
 
 
343 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  35.8 
 
 
343 aa  129  5e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  35.47 
 
 
323 aa  129  1e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  36.39 
 
 
326 aa  128  1e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  36.39 
 
 
326 aa  128  1e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  34.36 
 
 
336 aa  128  1e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  36.39 
 
 
326 aa  128  1e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  33.99 
 
 
330 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  30.82 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  32.51 
 
 
333 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  35.08 
 
 
346 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  36.31 
 
 
318 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  34.05 
 
 
335 aa  122  1e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  32.52 
 
 
332 aa  120  4e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  26.75 
 
 
318 aa  119  5e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  31.52 
 
 
380 aa  119  8e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  34.85 
 
 
343 aa  118  2e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  33.85 
 
 
343 aa  118  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  30.57 
 
 
343 aa  114  2e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  48.65 
 
 
297 aa  114  2e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  33.44 
 
 
324 aa  114  2e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  33.92 
 
 
349 aa  113  4e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  32.29 
 
 
331 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  8.96643e-06  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  33.23 
 
 
326 aa  111  2e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  33.64 
 
 
324 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  30.48 
 
 
367 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  34.33 
 
 
377 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  34.44 
 
 
376 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  34.14 
 
 
375 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  31.76 
 
 
320 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  29.97 
 
 
342 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  27.86 
 
 
368 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  29.88 
 
 
359 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  28.53 
 
 
369 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  27.11 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  24.77 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  23.48 
 
 
377 aa  89.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  33.63 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  22.05 
 
 
330 aa  85.9  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  30.43 
 
 
315 aa  85.9  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  23.17 
 
 
377 aa  85.5  1e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  25.62 
 
 
392 aa  75.9  9e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  23.45 
 
 
390 aa  68.9  1e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  21.07 
 
 
771 aa  66.6  5e-10  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  28.18 
 
 
378 aa  65.5  1e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  29.26 
 
 
351 aa  60.8  3e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  1.84518e-05 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  28.61 
 
 
359 aa  60.1  5e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  31.25 
 
 
968 aa  58.5  2e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  23 
 
 
770 aa  58.5  2e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  30.25 
 
 
679 aa  57.8  3e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  26.99 
 
 
375 aa  56.2  7e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  30.65 
 
 
989 aa  55.5  1e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  20.18 
 
 
372 aa  53.1  5e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  29.57 
 
 
1006 aa  51.2  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  34.82 
 
 
364 aa  49.7  6e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  35.48 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  26.64 
 
 
730 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>