More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1043 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  100 
 
 
238 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  89.08 
 
 
238 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  84.1 
 
 
239 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  83.68 
 
 
240 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  84.1 
 
 
239 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  43.46 
 
 
226 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 
206 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
201 aa  178  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  55.21 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  44.17 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 
203 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4339  NUDIX hydrolase  55.21 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.975502  normal  0.0924805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4234  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
208 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0154099  normal  0.59978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  40 
 
 
206 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
209 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  44.66 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  40.35 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  40.35 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  34.9 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  32.43 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  36.36 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
195 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  38.46 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  46.6 
 
 
203 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  38.46 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  41 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
198 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  31.58 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
195 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  40.18 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  28.77 
 
 
199 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
198 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  27.52 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  41 
 
 
194 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
222 aa  62  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2009  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.958398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
189 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 
200 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  35 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  32.08 
 
 
191 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
201 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  36.46 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
193 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
216 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
228 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
228 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
228 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4264  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.98705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  36.89 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  35.79 
 
 
197 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  38 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.25 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.25 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.25 
 
 
427 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  34.69 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.25 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.25 
 
 
333 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>