237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0015 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0062  tRNA-Gly  95.71 
 
 
76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.669958  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t23  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0018  tRNA-Gly  88 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0035  tRNA-Gly  88 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0034  tRNA-Gly  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0263488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0010  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0041  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297349  decreased coverage  0.00434413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0061  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.677288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0012  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000114825  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0008  tRNA-Gly  90 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0018  tRNA-Gly  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00221415  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0043  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.530353  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0040  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0035  tRNA-Gly  88.33 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0036  tRNA-Gly  88.33 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  86.84 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0028  tRNA-Gly  85.14 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  86.89 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0049  tRNA-Gly  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119188  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  92.68 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0044  tRNA-Gly  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0006  tRNA-Asp  89.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0032  tRNA-Gly  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0002  tRNA-Asp  89.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly02  tRNA-Gly  86.67 
 
 
79 bp  56  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0005  tRNA-Gly  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  85.53 
 
 
75 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  54  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607028  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  90.7 
 
 
73 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0016  tRNA-Ala  92.31 
 
 
73 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0028  tRNA-Ala  92.31 
 
 
73 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0010  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.560104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0100  tRNA-Gly  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0068  tRNA-Ala  92.31 
 
 
73 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0040  tRNA-His  100 
 
 
73 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0044  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.1121e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0048  tRNA-Gly  84.06 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  90.24 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0031  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.464558  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0209  tRNA-His  100 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.524642  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0709  tRNA-Val  88.68 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0020  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0183484  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  90.24 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000134783  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0259741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0016  tRNA-Gly  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0041  tRNA-Val  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0021  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00000256576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  84.21 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0035  tRNA-Val  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  93.75 
 
 
519 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0114  tRNA-Val  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_639  tRNA-Gly  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000240622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0018  tRNA-Val  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00275689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  92.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  92.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0015  tRNA-Val  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0048  tRNA-Gly  92.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0072  tRNA-Val  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0014  tRNA-Gly  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  84.21 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0072  tRNA-Gly  92.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0211705  normal  0.918041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>