174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0035 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0036  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  91.94 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0012  tRNA-Gly  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000114825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0062  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.669958  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly02  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0032  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0008  tRNA-Gly  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0006  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0216519  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t44  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0414415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0049  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0044  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0042  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000364982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0052  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202976  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0014  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0036  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly01  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.682857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0034  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0018  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00221415  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  95 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0053  tRNA-Gly  95 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000779558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  95 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000134783  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt18  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0037  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0013  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0036  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0037  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_639  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0014  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0014  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0014  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0030  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0041  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0036  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0048  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt11  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0048  tRNA-Gly  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000333522  normal  0.379894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0037  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00519956  normal  0.826758 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0027  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.877101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0018  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0605541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0026  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000373011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0039  tRNA-Gly  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0058  tRNA-Gly  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0033  tRNA-Gly  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.688616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>