More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0861 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  86.96 
 
 
161 aa  278  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  84.47 
 
 
161 aa  274  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  85.09 
 
 
161 aa  274  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  77.78 
 
 
162 aa  250  5.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  47.33 
 
 
159 aa  142  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  49.63 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  44.1 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  44.52 
 
 
158 aa  137  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  44.67 
 
 
158 aa  132  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  44.44 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  45.8 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  45.26 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  46.21 
 
 
141 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  47.73 
 
 
187 aa  122  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  41.67 
 
 
137 aa  121  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  43.18 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  40.71 
 
 
136 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  40.97 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  42.42 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  41.67 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  43.75 
 
 
139 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  42.96 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  43.7 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  40.97 
 
 
137 aa  114  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  43.97 
 
 
137 aa  114  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  37.88 
 
 
182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  41.61 
 
 
141 aa  107  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  36.5 
 
 
136 aa  101  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  37.4 
 
 
147 aa  100  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  35.88 
 
 
142 aa  96.3  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  37.59 
 
 
137 aa  91.3  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  35.25 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  36.67 
 
 
94 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 
95 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  41.33 
 
 
94 aa  58.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  38.46 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  49.15 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4919  ribosomal protein S19  41.27 
 
 
80 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0706755  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  39.68 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  44.44 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  41.33 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  37.78 
 
 
89 aa  55.1  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 
88 aa  55.1  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  36.62 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  45.61 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  40.85 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  40.85 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  42.03 
 
 
93 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  36 
 
 
93 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  39.74 
 
 
94 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  39.47 
 
 
94 aa  53.9  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  39.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  39.06 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  43.33 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  39.53 
 
 
93 aa  53.9  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  38.03 
 
 
93 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  38.67 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  37.66 
 
 
92 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  39.71 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1871  30S ribosomal protein S19  40 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  39.02 
 
 
92 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  37.68 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 
94 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  37.31 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  36 
 
 
94 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  37.68 
 
 
92 aa  53.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1700  30S ribosomal protein S19  40 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  37.33 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2077  30S ribosomal protein S19  40 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000362901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  37.5 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  37.84 
 
 
95 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  35.44 
 
 
93 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  42.11 
 
 
93 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  40.35 
 
 
93 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 
93 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  39.44 
 
 
92 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  37.84 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0088  30S ribosomal protein S19  47.17 
 
 
93 aa  52  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  37.84 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  40.62 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  37.88 
 
 
87 aa  52  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  40.35 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  38.03 
 
 
92 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  38.03 
 
 
91 aa  52  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  40.58 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  41.67 
 
 
91 aa  52  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  36.62 
 
 
94 aa  51.6  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  38.03 
 
 
92 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  37.8 
 
 
92 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  44.12 
 
 
92 aa  51.6  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  38.1 
 
 
93 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  33.72 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  33.78 
 
 
90 aa  51.2  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  39.34 
 
 
91 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  38.37 
 
 
93 aa  51.2  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  38.37 
 
 
93 aa  51.2  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>