34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3808 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  297  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  97.32 
 
 		 149 aa  291  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  73.97 
 
 		 149 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  60.56 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  51.01 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  46.21 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  41.22 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  39.31 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  39.86 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  44.53 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  37.06 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  52.63 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  32.85 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  30.88 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  32.33 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  30.23 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  30.61 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  30.61 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  29.2 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  36.26 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  32.84 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  29.71 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  28.68 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  27.86 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  27.08 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  38.46 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  33.75 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  28.87 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  40.98 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  32.38 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  26.43 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>