More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0806 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  100 
 
 
284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  57.34 
 
 
311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  51.26 
 
 
272 aa  288  8e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  44.13 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  43.62 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.64 
 
 
276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  42.81 
 
 
277 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  41.05 
 
 
274 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  39.18 
 
 
287 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.08 
 
 
277 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.72 
 
 
277 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.72 
 
 
277 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  38.99 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  45.07 
 
 
278 aa  199  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  40.85 
 
 
278 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  43.25 
 
 
268 aa  193  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  37.14 
 
 
295 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  41.81 
 
 
280 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  37.5 
 
 
372 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  37.01 
 
 
286 aa  185  7e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  43.25 
 
 
269 aa  185  9e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  42.86 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  42.19 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  38.38 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  38.38 
 
 
288 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  39.5 
 
 
275 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  36.3 
 
 
293 aa  182  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  37.15 
 
 
282 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  40.36 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.32 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.32 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  39.13 
 
 
356 aa  178  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  36.59 
 
 
296 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.51 
 
 
381 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  38.65 
 
 
271 aa  176  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  37.14 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.69 
 
 
371 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  41.92 
 
 
552 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  38.46 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  33.09 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.21 
 
 
382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  34.42 
 
 
355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1264  Prephenate dehydratase  37.09 
 
 
268 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  39.43 
 
 
552 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  36.24 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  37.37 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  32.73 
 
 
371 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  34.75 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  38.49 
 
 
360 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  34.84 
 
 
360 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.37 
 
 
371 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.38 
 
 
358 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  34.53 
 
 
374 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  36.36 
 
 
279 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  37.37 
 
 
355 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.74 
 
 
373 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.21 
 
 
357 aa  169  4e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  35.17 
 
 
413 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  38.43 
 
 
288 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.86 
 
 
387 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  34.72 
 
 
283 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  36.55 
 
 
283 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  35.84 
 
 
385 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
358 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
360 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
360 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
360 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.08 
 
 
357 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
360 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
360 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
360 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
360 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.69 
 
 
357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  36.55 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  36.33 
 
 
366 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  33.94 
 
 
402 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  36.2 
 
 
361 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.53 
 
 
374 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  36.21 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  36.21 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.75 
 
 
358 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  32.61 
 
 
366 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  34.88 
 
 
272 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.69 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0598  prephenate dehydratase  38.27 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00579273  normal  0.0174836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  35.42 
 
 
285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  37.32 
 
 
366 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  37.5 
 
 
304 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  37.06 
 
 
279 aa  165  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  36.21 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  36.21 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  35.11 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  36.21 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  34.17 
 
 
374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.68 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4552  prephenate dehydratase  36.55 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.17 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  39.35 
 
 
364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0682  prephenate dehydratase  36.55 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000690128  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.98 
 
 
360 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>