58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0463 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
497 aa  963    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  40.34 
 
 
432 aa  252  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  37.37 
 
 
435 aa  186  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  29.86 
 
 
600 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  37.5 
 
 
561 aa  153  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  27.65 
 
 
436 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  32.21 
 
 
460 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  31.38 
 
 
684 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  27.44 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  24.59 
 
 
727 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  28.52 
 
 
546 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2179  hypothetical protein  40.78 
 
 
323 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  27.73 
 
 
311 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  38.62 
 
 
426 aa  91.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  33.17 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  28.57 
 
 
271 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  27.51 
 
 
963 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  26.77 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0035  hypothetical protein  43.33 
 
 
520 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  28.83 
 
 
456 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  28.83 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  39.62 
 
 
1096 aa  77.4  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.51 
 
 
1085 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1135  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  29.58 
 
 
219 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  45.56 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  32.93 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  42.5 
 
 
823 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
752 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  26.13 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  29.95 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  41.3 
 
 
802 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  22.47 
 
 
750 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  29.6 
 
 
719 aa  63.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  39.22 
 
 
276 aa  62  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  30.37 
 
 
341 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1967  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  25.43 
 
 
533 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  45 
 
 
226 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  42.42 
 
 
379 aa  57  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  31.94 
 
 
416 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  31.58 
 
 
930 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4431  PEGA domain-containing protein  41.07 
 
 
283 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.373808  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4224  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 
925 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.674514  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  34.12 
 
 
364 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2480  hypothetical protein  32.91 
 
 
364 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  45.65 
 
 
465 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0575  PEGA domain-containing protein  28.57 
 
 
269 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.416846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2741  PEGA domain protein  29.03 
 
 
597 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
1122 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 
769 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4011  PEGA domain protein  23.08 
 
 
438 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0496099  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  36.07 
 
 
211 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0262  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
806 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297751  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1640  PEGA domain-containing protein  32.26 
 
 
265 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1438  hypothetical protein  37.21 
 
 
184 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00281988  hitchhiker  0.000303146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2647  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
605 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  35.38 
 
 
118 aa  43.5  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>