17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1640 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1640  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
265 aa  511  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0575  PEGA domain-containing protein  78.07 
 
 
269 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.416846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0261  PEGA domain-containing protein  77.32 
 
 
266 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00732448 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  27.5 
 
 
409 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  30.77 
 
 
426 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  37.93 
 
 
118 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  32.26 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  41.51 
 
 
533 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  31.15 
 
 
497 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  37.5 
 
 
456 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  37.5 
 
 
456 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  31.75 
 
 
435 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  35.48 
 
 
684 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2480  hypothetical protein  28.57 
 
 
364 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  29.85 
 
 
412 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  28.09 
 
 
219 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>