16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0261 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0261  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  508  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00732448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0575  PEGA domain-containing protein  76.95 
 
 
269 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.416846  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1640  PEGA domain-containing protein  77.32 
 
 
265 aa  374  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  25 
 
 
409 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  30.88 
 
 
426 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  32.26 
 
 
412 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  36.21 
 
 
118 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  35.29 
 
 
456 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  35.29 
 
 
456 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  36 
 
 
684 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  38.33 
 
 
533 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  29.23 
 
 
416 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  26.24 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  32.79 
 
 
497 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  26.76 
 
 
435 aa  42.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  33.82 
 
 
379 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>