More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0003 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 		 424 aa  875    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  64.39 
 
 		 415 aa  568  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  60.87 
 
 		 410 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.39 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  56.56 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  52.38 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  53.46 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  51.92 
 
 		 413 aa  431  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  53.08 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  50.35 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  49.3 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  47.83 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  47.16 
 
 		 411 aa  378  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  47.74 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  47.03 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  45.58 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  47.03 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  45.5 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  43.4 
 
 		 411 aa  332  1e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.12 
 
 		 451 aa  326  5e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.68 
 
 		 439 aa  325  8.000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.71 
 
 		 429 aa  299  7e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  38.26 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.63 
 
 		 417 aa  269  7e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.33 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.5 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.81 
 
 		 447 aa  256  6e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.81 
 
 		 418 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  32.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  31 
 
 		 325 aa  160  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  34.97 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  32.85 
 
 		 349 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  30.92 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  30.38 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  29.91 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  30.97 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  29.68 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  29.68 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  29.68 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  29.68 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  29.68 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  29.39 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  29.91 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  30.64 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  30.64 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  33.54 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  30.12 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  31.55 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  28.99 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  31.89 
 
 		 327 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  28.99 
 
 		 327 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  29.97 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  28.74 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  28.74 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  28.74 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  28.74 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  28.74 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  28.74 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  29.15 
 
 		 347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  28.74 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  28.45 
 
 		 338 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  28.45 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  30.99 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  29.31 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  29.58 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2347  cytoplasmic asparaginase I  28.94 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109422  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  31.69 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2092  cytoplasmic asparaginase I  29.26 
 
 		 338 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1983  cytoplasmic asparaginase I  29.26 
 
 		 338 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  30.82 
 
 		 355 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  30.77 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  30.61 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  30.82 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  30.92 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  30.82 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  28.15 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  29.48 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1680  cytoplasmic asparaginase I  27.86 
 
 		 339 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  30.56 
 
 		 330 aa  124  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  28.61 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  31.63 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1388  cytoplasmic asparaginase I  28.15 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0184597  normal  0.373487 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  30.34 
 
 		 347 aa  122  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  30.9 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  30.9 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1969  cytoplasmic asparaginase I  27.7 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.316331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1421  cytoplasmic asparaginase I  28.15 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0271356  normal  0.712342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1405  cytoplasmic asparaginase I  28.15 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  normal  0.0252011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1881  cytoplasmic asparaginase I  28.15 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00109074  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  30.9 
 
 		 332 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  29.24 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  27.11 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  27.49 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  29.74 
 
 		 335 aa  120  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  30.2 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  31.07 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  27.41 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2584  cytoplasmic asparaginase I  26.61 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  28.32 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5627  asparaginase  29.57 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0567778  normal  0.243467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>