60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3646 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  100 
 
 
137 aa  277  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  54.01 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  55 
 
 
132 aa  124  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  47.41 
 
 
137 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  44.85 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  45.11 
 
 
143 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  43.85 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  46.55 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  46.55 
 
 
136 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  45.52 
 
 
141 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  43.1 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  45.69 
 
 
136 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  39.85 
 
 
135 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  39.57 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  36.03 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  40.29 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  38.52 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  36.79 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  34.51 
 
 
145 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  38.81 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.6 
 
 
147 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  36.54 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  29.2 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  31.86 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  31.58 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  28.24 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  33.62 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  34.21 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  31.01 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  31.62 
 
 
149 aa  66.6  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  26.36 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  31.54 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  30.22 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  28.7 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  32.69 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  29.41 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  32.2 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  29.17 
 
 
136 aa  57.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  32.04 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  42.03 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  27.05 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  26.42 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  26.67 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  30.08 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  29.81 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  32.54 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  26.17 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  28.09 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  21.9 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  24.76 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  25.19 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  31.78 
 
 
292 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>