More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0412 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 100 aa  194  2.0000000000000003e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  74.75 
 
 		 99 aa  159  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  58.76 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  52.58 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  52.08 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.55 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  43.3 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  42.45 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  42.27 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  40.38 
 
 		 104 aa  87.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.72 
 
 		 223 aa  87.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  42.27 
 
 		 188 aa  86.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  41.18 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  40.78 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  45.36 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  83.6  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  37.86 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  40.2 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>