More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03924 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  100 
 
 
146 aa  298  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  70.71 
 
 
150 aa  210  6e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  69.57 
 
 
161 aa  204  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  67.59 
 
 
150 aa  204  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  69.06 
 
 
149 aa  203  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  73.72 
 
 
179 aa  202  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  69.23 
 
 
149 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  70.5 
 
 
148 aa  197  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  67.36 
 
 
151 aa  197  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  68.31 
 
 
149 aa  196  8e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  65.75 
 
 
153 aa  195  1e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  67.61 
 
 
148 aa  194  2e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  69.78 
 
 
146 aa  194  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  69.57 
 
 
148 aa  193  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  2.93709e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  67.83 
 
 
151 aa  192  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  67.83 
 
 
146 aa  191  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 
150 aa  191  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 
151 aa  191  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  69.06 
 
 
148 aa  191  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  68.35 
 
 
147 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  68.35 
 
 
147 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  67.86 
 
 
150 aa  190  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.86 
 
 
150 aa  190  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  67.14 
 
 
147 aa  189  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  69.57 
 
 
150 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 
144 aa  188  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 
144 aa  188  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1369  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.75 
 
 
159 aa  188  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  68.57 
 
 
149 aa  188  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  60.96 
 
 
153 aa  187  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0445  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 
144 aa  187  6e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4416  3-dehydroquinate dehydratase  68.46 
 
 
150 aa  187  6e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0161291  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  67.39 
 
 
151 aa  186  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  67.39 
 
 
151 aa  186  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  67.39 
 
 
151 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  66.9 
 
 
144 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0245  3-dehydroquinate dehydratase  70.16 
 
 
150 aa  185  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0460  3-dehydroquinate dehydratase  69.77 
 
 
150 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  67.63 
 
 
146 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0393  3-dehydroquinate dehydratase  69.77 
 
 
150 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1203  3-dehydroquinate dehydratase  69.77 
 
 
150 aa  185  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.802728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  67.63 
 
 
146 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.02213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  67.63 
 
 
146 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.34533e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  67.63 
 
 
146 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0255  3-dehydroquinate dehydratase  70.16 
 
 
150 aa  183  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.01 
 
 
150 aa  181  2e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  65 
 
 
145 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 
152 aa  176  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  66.91 
 
 
141 aa  176  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.39911e-15  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  63.57 
 
 
155 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  63.57 
 
 
155 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 
162 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3840  3-dehydroquinate dehydratase  66.94 
 
 
150 aa  174  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0684157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3682  3-dehydroquinate dehydratase, type II  66.94 
 
 
150 aa  174  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0370  3-dehydroquinate dehydratase  67.44 
 
 
147 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  62.59 
 
 
149 aa  172  2e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.69 
 
 
148 aa  172  2e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 
145 aa  171  3e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  62.24 
 
 
162 aa  171  3e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  64.23 
 
 
147 aa  171  4e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  1.05156e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 
167 aa  170  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.17323e-06  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 
145 aa  170  6e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  63.04 
 
 
146 aa  170  7e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0050  3-dehydroquinate dehydratase  64.29 
 
 
167 aa  170  7e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.312759  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 
149 aa  169  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 
207 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  62.96 
 
 
156 aa  169  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3285  3-dehydroquinate dehydratase  68 
 
 
151 aa  169  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
207 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
207 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 
148 aa  167  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
150 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
150 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
150 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
150 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
150 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.26 
 
 
145 aa  166  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 
172 aa  166  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
145 aa  165  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 
149 aa  165  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 
156 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 
150 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 
153 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  61.7 
 
 
148 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 
153 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
145 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 
148 aa  164  3e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  7.97805e-05 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 
151 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 
154 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 
150 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 
150 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 
150 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 
150 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 
150 aa  163  6e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.60325e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 
151 aa  163  6e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  59.7 
 
 
160 aa  163  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 
151 aa  162  2e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 
148 aa  162  2e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>