More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02452 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  100 
 
 
639 aa  1311    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  35.94 
 
 
632 aa  343  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  30.23 
 
 
640 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31.2 
 
 
629 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  30.83 
 
 
630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  31.04 
 
 
647 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  30.37 
 
 
634 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  31.05 
 
 
644 aa  265  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  30.55 
 
 
629 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  30.11 
 
 
654 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  30.67 
 
 
635 aa  256  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  32.68 
 
 
684 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  29.42 
 
 
660 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  27.54 
 
 
695 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  29.88 
 
 
636 aa  248  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  31.98 
 
 
642 aa  247  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  28.28 
 
 
690 aa  247  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  31.41 
 
 
660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  29.62 
 
 
662 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  29.68 
 
 
635 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  30.22 
 
 
645 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  29.03 
 
 
665 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  29.41 
 
 
643 aa  240  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  28.77 
 
 
662 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  31.19 
 
 
675 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  28.44 
 
 
645 aa  238  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  31.52 
 
 
647 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  28.29 
 
 
671 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  29.97 
 
 
626 aa  236  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  31.13 
 
 
651 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  29.67 
 
 
652 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  27.8 
 
 
627 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  27.47 
 
 
695 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29.16 
 
 
629 aa  233  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  27.48 
 
 
628 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.8 
 
 
616 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.81 
 
 
695 aa  227  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  31.17 
 
 
678 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  32.85 
 
 
675 aa  224  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  29.85 
 
 
662 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  30.38 
 
 
759 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  26.97 
 
 
660 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  28.46 
 
 
683 aa  220  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  28.35 
 
 
665 aa  220  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.48 
 
 
656 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.11 
 
 
656 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  31.89 
 
 
658 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  37.23 
 
 
715 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.78 
 
 
716 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  32.42 
 
 
690 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  31.84 
 
 
667 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  32.02 
 
 
690 aa  212  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  29.66 
 
 
615 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  32.42 
 
 
777 aa  211  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  29.96 
 
 
688 aa  211  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  28.64 
 
 
679 aa  210  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  28.13 
 
 
673 aa  210  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  26.36 
 
 
675 aa  210  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  30.25 
 
 
679 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.18 
 
 
660 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  30.56 
 
 
711 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  28.07 
 
 
660 aa  204  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  29.76 
 
 
637 aa  203  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  34 
 
 
614 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  30.83 
 
 
642 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  35.94 
 
 
647 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  29.17 
 
 
675 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  38.2 
 
 
685 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  34.67 
 
 
691 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  29.53 
 
 
625 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  27.52 
 
 
681 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  32.08 
 
 
658 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  27.93 
 
 
657 aa  183  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  30.31 
 
 
658 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  27.87 
 
 
720 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  27.33 
 
 
657 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  30.52 
 
 
658 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  26.19 
 
 
621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  31.86 
 
 
726 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  31.86 
 
 
726 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  31.86 
 
 
726 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.09 
 
 
638 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  26.84 
 
 
682 aa  177  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  26.52 
 
 
742 aa  177  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  28.8 
 
 
675 aa  177  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  33.71 
 
 
690 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  29.33 
 
 
676 aa  176  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3768  acyltransferase 3  25.26 
 
 
675 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0162791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  34.45 
 
 
690 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  32.85 
 
 
603 aa  170  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  32.61 
 
 
710 aa  170  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  32.61 
 
 
710 aa  170  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  32.69 
 
 
718 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  32.78 
 
 
598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  28.05 
 
 
679 aa  167  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2135  acyltransferase 3  30.2 
 
 
646 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0620882  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  30.75 
 
 
622 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  25.65 
 
 
632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  35.98 
 
 
734 aa  163  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  29.92 
 
 
695 aa  163  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>