48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5904 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  46.67 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  41.67 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3919  TadE family protein  41.32 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  35.94 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  40.38 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  29.29 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  29.46 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  31.46 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  47.83 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  39.66 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  30.34 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  30.34 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  30.34 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  28.97 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  32.5 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  56.25 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  40 
 
 		 209 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  39.34 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  42.86 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  33.33 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  37.5 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  36.84 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  31.76 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  38.46 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  44.26 
 
 		 722 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  44.26 
 
 		 180 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  47.27 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  34.92 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  37.5 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  32.06 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  48 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  50 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2498  TadE-like  31.25 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0777596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  35.09 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  47.92 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  30.59 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  42.86 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  42.11 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  44.44 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  45.45 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  45.45 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  33.87 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  45.45 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  30.59 
 
 		 153 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  35.94 
 
 		 189 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  35.59 
 
 		 129 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>