80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0435 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  100 
 
 		 413 aa  815    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  69.49 
 
 		 413 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  65.62 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  59.86 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.63 
 
 		 413 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  44.31 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  44.31 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  45.52 
 
 		 414 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  43.93 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  36.69 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.94 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  36.06 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.32 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  34.72 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  34.72 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.43 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  32.2 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  32.17 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  31.36 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.17 
 
 		 432 aa  130  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.09 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.53 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  26.06 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  28.65 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 611 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  29.14 
 
 		 492 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  27.42 
 
 		 465 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  27.42 
 
 		 515 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  26.28 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  26.28 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  27.42 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  27.42 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  27.42 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  25.7 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  27.42 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  25.64 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  26.21 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.88 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  23.73 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  24.27 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 385 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  24.7 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  24.7 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.82 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  26.1 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  26.1 
 
 		 652 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 368 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  24.57 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.46 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  23.12 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  23.12 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  27.27 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  26.92 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  25.89 
 
 		 391 aa  89.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  25 
 
 		 585 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.23 
 
 		 371 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 371 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  28.2 
 
 		 569 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  25.81 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  28.03 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  25.28 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  27.48 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  24.08 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  25.58 
 
 		 590 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  23.18 
 
 		 579 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  24.85 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  24.18 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  24.17 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  21.6 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  18.46 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  22.5 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  23.78 
 
 		 388 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  28.17 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  27.66 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>